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個(gè)人簡(jiǎn)介

教育經(jīng)歷：

2003.9-2007.7   哈爾濱工業(yè)大學(xué) 計算機科學(xué)與技術(shù)專(zhuān)業(yè) 本科

2007.9-2009.7   哈爾濱工業(yè)大學(xué) 計算機科學(xué)與技術(shù)專(zhuān)業(yè) 碩士

2009.9-2015.3  哈爾濱工業(yè)大學(xué) 計算機科學(xué)與技術(shù)專(zhuān)業(yè) 博士

工作經(jīng)歷:

2015.5-2020.12   哈爾濱工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院  講師

2020.12-至今   哈爾濱工業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院  副教授

Personal Profile

EDUCATION:

B.Eng.Harbin Institute of Technology, Harbin, China, Computer Science and Technology, 2003-2007

M.Eng.Harbin Institute of Technology, Harbin, China, Computer Science and Technology, 2007-2009  

Ph.D. Harbin Institute of Technology, Harbin, China, Computer Science and Technology, 2009-2015

ACADEMIC APPOINTMENTS:

Lecturer, Harbin Institute of Technology, Harbin, China, Biomedical Engineering, 2015-2020

Associate Professor, Harbin Institute of Technology, Harbin, China, Biomedical Engineering, 2020-present

研究方向和領(lǐng)域

生物信息學(xué)

Bioinformatics

研究?jì)热?/span>

主要研究方向為基因組大數據分析方法與軟件，包括三方面內容：

1. 基因組學(xué)機器學(xué)習，研究機器學(xué)習算法在基因組學(xué)問(wèn)題上的應用與改進(jìn)；

2. 基因組注釋與可視化，研究對容量龐大、格式多樣、關(guān)系復雜的基因組大數據進(jìn)行注釋及可視化方法與軟件；

3. 多組學(xué)數據分析，運用統計、計算方法，分析多組學(xué)數據、解決生物學(xué)問(wèn)題。

Research Interests 

The major research area is methods and software of genome bigdata analysis, including 3 topics:

1. Machine learning in genomics: Improvement and application of machine learning algorithm for genomics.

2. Genome annotation and visualization: Annotation and visualization methods/software for genome bigdata with mass volume, various formats and complex relationship.

3. Multi-omics data analysis, Analyzing multi-omics data by computational and statistical methods, solving biological problem.

研究成果

代表性論文

1. Juan, L.*, Wang, Y., Jiang, J., Yang, Q.,Wang, G., and Wang, Y.* (2020). Evaluating Individual Genome Similarity with a Topic Model. Bioinformatics.（SCI檢索）

2. Juan, L.*, Wang, Y., Jiang, J., Yang, Q.,Jiang, Q., and Wang, Y.* (2020). PGsim: A Comprehensive and Highly Customizable Personal Genome Simulator. Front Bioeng Biotechnol 8, 28.（SCI檢索）

3. Juan, L., Liu, Y., Wang, Y., Teng, M.,Zang, T., and Wang, Y. (2015). Family genome browser: visualizing genomes with pedigree information. Bioinformatics 31, 2262-2268. （SCI檢索）

4. Juan, L., Teng, M., Zang, T., Hao, Y.,Wang, Z., Yan, C., Liu, Y., Li, J., Zhang, T., and Wang, Y. (2014). The personal genome browser: visualizing functions of genetic variants. Nucleic Acids Res 42, W192-197. （SCI檢索）

5. Juan, L., Wang, G., Radovich, M.,Schneider, B.P., Clare, S.E., Wang, Y., and Liu, Y. (2013). Potential roles of microRNAs in regulating long intergenic noncoding RNAs. BMC Medical Genomics 6 Suppl 1,S7. （SCI檢索）

獲獎

2019年度黑龍江省科學(xué)技術(shù)一等獎（排名4）

開(kāi)設的課程

生物信息學(xué)

Bioinformatics

生物數據庫及軟件應用基礎

Foundation of Biological Database and Software

基因組信息學(xué)

Genome Informatics